百香果与罗汉果的主要区别在于叶、花、果、种的不同。百香果是西番莲科西番莲属植物，叶椭圆形心形，果实卵球形，无果肉。罗汉果是葫芦科植物，叶子是心形的，皮肤很薄，干后很脆。

百香果与罗汉果叶型差异明显。百香果叶基部呈纸质、楔形或心形，半羽状结构，两侧呈心形、长方形；罗汉果叶为膜质、椭圆形、心形或三角椭圆形，从百香果中非常明显。

罗汉果和百香果的花也有一定的差异。百香果花的基部颜色为淡绿色，中部为紫色，顶部为类似白色的浅色，罗汉果的颜色为黄色，整体颜色变化不大，有黑色腺体斑点，与百香果花完全不同。

罗汉果与百香果果实的差异最大。百香果为卵圆形，果壳较硬，基本无果肉，内部为黄色汁液和果核，罗汉果果形近似长方形或球形，果皮很薄，干燥后变脆。

百香果与罗汉果最根本的区别在于其种属不同。百香果又称蛋果，是西番莲科西番莲属植物的果实；罗汉果又称金不换、假苦瓜、神仙果，是葫芦科多年生藤本植物的果实。