植物检疫证书需要去植保站或植保局、农林局办理。植保站或植保局的全称一般为植保植检站或植检植保站，工作人员是事业编制，主要从事病虫害预测测报、植物检疫、农业技术推广、试验示范、农药监管等工作，有的还具有执法职责。

申请人持相关材料向农林局窗口提出申请，由窗口工作人员初审。申请材料符合条件的，当场受理；申请材料存在可以当场更正的错误的，申请人当场更正后受理；对材料不齐全、不符合法定形式的，当场一次告知申请人应当补正的全部材料。

在承诺期内，经审查符合法定条件、标准的，依法作出准予许可的书面决定，由窗口工作人员颁发《植物检疫证书》。