幼虫又称菌蛆，主要取食子实体造成隧道而影响品质，且造成的伤口还很易被病菌感染而腐烂。防治菇蝇在不同时期应采用不同方法。此菇前有菌蛆大量发生，可用敌敌畏按0．90千克／100平方米的量进行熏蒸，同时在每个培养块上再喷0．15千克的1％氯化钾或氯化钠溶液(可用5％食盐水代替)；出菇后有菌蛆为害可喷鱼藤精、除虫菌酯，烟碱等低毒农药。(烟碱可自制：取0．50千克烟梗，加水5千克煮沸后取溶液喷洒)。此外还应加强通风，调节棚内温湿度来恶化害虫生存环境，达到防治其为害的目的。