西瓜的腋芽萌发力很强，很容易发杈。如果放任不管，因枝杈太多，耗费大量养分。若肥力不足，必然会引起瓜小、产量低、品质差的不良结果，所以必须进行不同程度的整枝管理。整枝的方式很多，目前南北各地应用最广泛的是双蔓整枝和三蔓整枝。双蔓整枝多是一主一副，即除主蔓外在基部选留一健壮侧蔓，其余侧枝全部摘除，这种方式多在早熟栽培上应用。三蔓整枝通常都是一主两副，除主蔓外在基部选留两条健壮侧蔓，其余侧蔓全部摘除，这种方式多在露地中晚熟栽培上应用。不论是双蔓整枝还是三蔓整枝，当果实坐稳后，植株体内养分集中往果实中运转时，枝蔓顶端生长已很缓慢，不会消耗大量养分，此时一般均停止整枝打杈工作。