香蕉嫩果易受病虫侵害。病害主要是黑星病、炭疽病等，虫害主要为花蓟马等。花蓟马在抽蕾后未开苞时已进入花蕾为害嫩果，故现蕾后就应喷杀虫剂防治，防病通常在套袋前喷药，主要是防治黑星病。目前所有的香蕉收购商均是以果指长度，在断蕾时可对果穗喷施植物激素或营养剂，激素主要有2，4D、6-苄基嘌呤等营养剂主要有磷酸二氢钾、尿素、植宝素、植保18等。但嫩果抗性差，浓度太高会造成药害，必须小心应用，尤其是2，4-D激素。高温期蕉果对药剂的敏感性强，浓度应稍低为宜，蕉果以刚断蕾48小时内为最佳喷施期，药剂必须有良好的展布性。喷雾器的雾化效果好且均匀为宜。喷洒时对下半穗果的喷施量宜稍大。由于2，4-D是国际市场(如日本)严格禁用的药剂，所以6-苄基嘌呤和赤霉素应作为果指生长主要调节剂使用。但是，当果指长度超过30厘米时，果指较难长饱满，生育期也较长，应在挂果期间加强追肥及水分管理。目前，广东省农业科学院果树研究所香蕉研究室研制的“丰果素”，经多个蕉园实验，效果极其显著，能增长果指2厘米左右。因此，该药剂颇受欢迎。