番茄猝倒病由真菌鞭毛菌亚门瓜果腐霉菌侵染所致。病菌以卵孢子随病残体留在地上越冬，条件适宜时卵孢子萌发，产生芽管，直接侵入幼芽，或芽管顶端膨大后形成孢子囊，以游动孢子借风雨或灌溉水传播幼苗，引起初侵染。湿度大时，病部产生的孢子囊和游动孢子进行再侵染。

病菌喜高温、高湿环境，但对温度要求不严。感病生育期在幼苗期。

苗床连作、棚内温度过低、湿度过高、播种过密、光照差、通风不良、管理粗放等的田块发病重。年度间早春低温阴雨天气多的年份发病严重。

苗床选择：宜选择三年以上未种过茄果类蔬菜、地势高燥、排水方便、土质肥沃、背风向阳的田块作苗床。

种子消毒：干种子用25%甲霜灵粉剂加70%代森锰锌（9:1）1500-2000倍液拌种，以种子表面湿润为宜，用药量是种子重量的0.4%，浸种15-30分钟，浸后清水冲洗2-3次，晒干或催芽播种。

床土消毒：每平方米苗床施用25%甲霜灵可湿性粉剂9克加70%代森锰锌可湿性粉剂1克兑细干土5千克拌匀，施药前先把苗床底水打好，且*浇透，水下渗后先将1/3充分拌匀的药土撒在畦面上，播后再把其余的2/3药土覆盖在种子上面。

加强苗床管理：苗床四周开好深沟，以有利于排水、降低地下水位；合理控制苗床的温湿度，苗床湿度过大时，可撒上一层干细土吸湿；肥水要小水、小肥轻浇，同时注重适时、适度通风换气。加强调查，及时拔除病苗、死苗，并集中深埋或烧毁。

药剂防治：发病初期及时用药，7-10天喷药*，连用2-3次，具体视病情发展而定。药剂可选用68%金雷水分散粒剂600-800倍液，75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%立枯净可湿性粉剂1000倍液，或80%大生M-45可湿性粉剂600倍液等，喷雾防治。