苦瓜根系生长差造成黄叶有可能是根部病害引致，如苦瓜根线虫病。该病由根线虫侵染苦瓜所致，线虫会通过锋利的口针穿刺根部吸取当中的营养。与此同时，根线虫的分泌物（唾液）也会一并进入根部组织而产生化学作用，根组织受害会膨大增生，须根和侧根上形成许多大小不等的瘤状物根结。根结初期呈乳白色，随着危害的不断加重逐渐变成黑褐色。根结会阻碍根系对营养和水分的吸收及输送，因此地上部病株会出现黄叶黄化、生长衰退等现象，严重的甚至萎蔫、枯萎而死。

除了根线虫危害造成的黄叶之外，还会传播其它的病害。调查发现，在苦瓜根线虫病发生严重的地方，叶枯病、炭疽病、蔓枯病等病害也比较严重。这是因为根线虫在危害时会刺穿苦瓜的根部，根部因此会形成许多的伤口，为其它病害、病菌的入侵提供了途径，与根线虫共同危害加剧病情。

因此，预防苦瓜黄叶菜农要防好苦瓜根线虫病。当前正值春季种植苦瓜的时期，相关的专家建议菜农可在苦瓜移栽前使用杀线剂进行防治，可有效控制土壤中的根线虫繁殖危害。菜农可在苦瓜育苗嫁接前用盈辉杀线剂颗粒混肥撒施、沟施或穴施，持效期长达2-3个月。另外如果苦瓜在生长期受到危害，则可用盈辉杀线剂水剂兑水灌根、冲施。