薄皮甜瓜的嫁接一般都采用靠接方法，为缩短育苗时间和嫁接后的成活率的提高，可采用砧木和接穗同营养钵播种的方法。即把直径12厘米左右，高10厘米左右的营养钵装好营养土后浇透水(需要注意的是装土时不可过满，土面距营养钵顶要有1厘米左右的距离，以方便浇水)，然后放进一粒已经发芽的甜瓜种子，盖上一层细土。甜瓜种子播后11到15天，再在营养钵的不同位置放一粒已经露白的黑籽南瓜子，盖上一层细土。

当南瓜子叶展开，真叶露心时为薄皮甜瓜的嫁接适期。嫁接时先取掉南瓜的生长点，在子叶下方0.5—1厘米处自上而下斜切一刀，刀口深度不超过茎粗的二分之一。然后把砧木和甜瓜幼苗的切口对齐靠紧，用嫁接夹固定好，也可用塑料条或胶纸缠绕。

甜瓜苗嫁接好后立即放人保温保湿效果好的塑料小拱棚内，进行遮光或半遮光。温度白天控制在30—35℃，夜间18—20℃。3—5天后逐步撤去遮光物，进行通风。并用百菌清烟雾熏蒸*，预防病害的发生。嫁接后10天左右，待伤口愈合后将甜瓜苗的根部剪断。以后进行正常的温光水肥管理即可。