嫁接育苗时，要加强温度管理，白天苗床温度保持在26℃-28℃，夜间苗床温度保持在18℃-20℃，嫁接后3-4天土壤温度保持在24℃左右，适当的温度有利于接口的愈合。并且在嫁接口喷施新高脂膜有效抑制外部病菌侵入，提高嫁接率。在瓜苗的接口完全愈合后苗床的温度可与常规育苗同样管理。并且在嫁接育苗时还需光照管理，瓜苗嫁接后应立即进行遮光管理，至嫁接口开始愈合后每天逐渐给予一定的光照，从1小时起，每天增加1小时，逐渐增加光照时间，直至瓜苗接口完全愈合，恢复正常的光照。

在湿度管理上也要适当，在西瓜瓜苗嫁接后苗床内空气湿度应不低于95%，常采用的措施是在苗床上再加盖小拱棚，小拱棚上再加盖厚纸或草帘，这样既增加了湿度，遮挡了强光照，又使温度不致太高。