西瓜苗期的病害主要有猝倒病、锈根病和立枯病。（1）猝倒病：猝倒病是西瓜苗期常发生的病害。幼苗被病菌侵染后，基部出现水浸状淡黄褐色病斑。接着，病斑迅速绕茎1周，变为褐色并缢缩。病株很快倒伏 ，病势发展很快，所以叫猝倒病。倒伏后的幼苗短期内仍为绿色。此病蔓延很快。猝倒病的病原菌是藻状菌，腐生性很强，可长期在土壤中生存。其游动孢子借助于水进行再侵染。苗床土温底、湿度大、白天光照不足，幼苗生长瘦弱时*易发病。另外，播种量大、幼苗过密、水肥过多、通风不良等因素都可引起发病。猝倒病的防治方法：一是选用无病床土育苗。二是采用0.3%的45%代森锌可湿性粉剂或50%福镁双可湿性粉剂拌种。三是用65%代森锌可湿性粉剂1份，掺细土1000份作种子覆土。四是向床面撒草木灰或细干土，以降低湿度和提高温度。五是用硫酸铜粉2份、碳酸铵粉11份，充分混匀后装瓶密闭1昼夜配成铜铵合剂。用400倍铜铵合剂溶液喷雾，每7～10天喷1次。用500倍70%敌克松原松粉溶液灌根。（2）锈根病：也叫烂根病，当幼苗根系处于低温、多温条件下易感此病。发病初期子叶表现下垂，幼苗生长极慢。根部*初呈黄锈色，迟迟生不出新根。严重时则导致烂根，幼苗死亡。锈根病是一种生理病害。当苗床管理不当，连续阴雨天，温度下降严重，床土低温、高湿，根系不能正常进行生命活动，因而导致发病。预防方法：一是出苗后保持地温在18℃以上，控制土壤湿度，少浇水，浇温水。二是早春采用温床育苗。（3）立枯病：当幼苗感病后，茎基部一侧产生椭圆形褐色病斑。发病初期，病苗中午萎蔫，早晚恢复正常。以后病斑扩大，幼茎干缩，幼苗枯萎死亡。湿度大时，病部产生淡褐色稀疏丝状体，即菌丝体。大苗受害后，茎部呈溃疡状，地上部变黄，萎蔫死亡。立枯病菌属于真菌中的半知菌，其发病温度为17～28℃，12℃以下或30℃以上时病菌受抑制，不侵染发病。在高湿条件下发病快。菌丝及菌核在土中可存活4～5年。其传播媒介有风、雨、水等。土壤湿度大、低温弱光或密度过大时都易发病。立枯病防治方法：一是选用有种过瓜类的大田土作育苗土，或进行苗床消毒。消毒方法是，用50%多菌灵和细土按1：200之比做成药土，于播种前撒在畦面上并与床土拌匀，播种后床面再撒一层。二是出苗后出现点片发病时，应及时将上述药土撒于病苗基部，同时将周围发病幼苗基部也撒上药土。三是加强苗床管理，注意适时通风、浇水，防止土壤湿度过大，及时间苗，防止徒长。阴冷天气时应尽量提高苗床地温，减少浇水量。