1年生的桔梗不仅产量低，而且有效成分含量低。研究表明1年生桔梗的总皂苷含量仅为2.26%，2年生桔梗的总皂苷含量为3.34%。江苏药材基地的大田生产调查结果表明，1年生的单株鲜根平均重量为6.73克，2年生的单株鲜根平均重量为15.56克，2年生的桔梗其根的生长量为1年生的231.2%，故栽培的药用桔梗至少应生长2年以上才能进行采收。2005 年对东北不同生长季节的桔梗皂苷D进行研究表明，秋季9月、10月桔梗中桔梗皂苷D的含量最高，进入秋季的11月有效成分急剧衰减，第2年春节4月含量也较低，进入5月份开始营养生长，含量又开始上升，因此将秋季最佳合理采收期定为9~10月份，质量较佳，但采收也不宜过早，过早其根部尚未充实，折干率低影响质量。

桔梗直播生长3年，育苗移栽后生长2年即可采收。采收期可在秋季或春季桔梗萌芽前进行。以秋季采的体重质实，质量较好。

一般在地上茎叶枯萎时采挖。