黑穗病，又称黑粉病。由种子和土壤带菌。主要危害穗部，也危害叶部。被害部表现为畸形或呈瘤状，表皮破裂后内有大量黑粉。穗部被害后肿大成球形或扁球形的褐包，内部充满黑褐色粉末。

人工防治：建立无病留种地，种子单收、单藏。实行轮作。进行种子处理。当发现病株应及时拔除烧毁。加强田间管理，合理施用氮肥，适当增施有机肥料与磷钾肥。

药物防治：病穴用5%石灰乳消毒。用60℃温水浸种20分钟，再用布袋包好置于3%~5%生石灰水中浸2~3天，或用1：1：100波尔多液浸种24~72小时，捞出晾干后播种，可防治黑穗病。播前用粉锈宁拌种，效果好。在薏苡抽穗前用800~1000倍的多菌灵可湿性粉剂喷雾防治，每隔5~6天喷1次，连续喷药2~3次。