在结冻前将选做种用的果实，用温水(15℃)浸泡1~2天，至果肉涨起时搓去果肉。五味子的秕粒很多。五味子出种率60%左右，在搓果肉的同时可将浮在水面上的秕粒除掉。搓掉果肉后的种子再用清水浸泡5~7天，使种子充分吸水，每隔两天换一次水，在换水时还可清除一部分秕粒。

五味子种子浸泡后捞出控干水分，调节含水量在10%，与2~3倍于种子的湿沙混匀，然后装箱放在室内(5℃~15℃)或埋在室外0.5米深的坑中，上面覆盖10~15厘米的细土，再盖上柴草或草帘子，进行低温处理。第二年5~6月份可有70%种子裂口，即可播种。处理场地要选择高燥地点，以免水浸烂种。