野生的黄连多见于海拔约1200~1800米的高寒山区，栽培黄连时适宜选择约海拔1400~1700米的地区。高海拔地区气候寒冷，生长的季节较短，黄连的生长速度就比较缓慢，但是根茎却很坚实，质量比较好。

在低海拔的山区，气温比较高，黄连的生长速度比较快，茎叶繁茂但适根茎却不充实，品质较次，而且很容易感染病虫害。所以地势的高地影响着黄连的质量，栽种之前要仔细选地，这样才能生产出高质量的黄连。