天麻栽培使用小块茎即米麻、白麻做种源，培养在蜜环菌的菌床上，长出新的米麻和白麻及个头更大的箭麻，属于无性繁殖栽培方法。在长期的无性繁殖栽培过程中，由于温度、湿度、水分、土壤条件、病虫害的影响和变化，促使天麻块茎的生长发育能力和繁殖的机能逐渐退化。天麻块茎的产量一代比一代低，品质一代比一代差，个体形态从椭圆体变成长条状，单个重量越来越轻。

天麻的有性繁殖栽培就是让天麻开花，人工授粉受精后产生的有性繁殖的种子，再让种子萌发发育成米麻、白麻进行栽培的方法。由于天麻花朵的特殊结构，花粉下面与柱头之间有一个间隔状的萼片，使得花粉无法自然掉落在柱头上面进行自然授粉，需要有专门的昆虫钻入花朵以后才可能被授粉，因此在自然状态下天麻开花后的授粉率是非常低的。人们在野外观察到的天麻，开花以后结的蒴果往往都是空壳，很难看见成熟的种子。因此，必须对天麻进行人工授粉。

人工授粉的目的是把花粉放在柱头上面进行授精，使子房膨大、结果，产生种子。每株天麻上有30~80朵花，每朵花结1个蒴果，每个蒴果内有2万～3万粒种子。理论上每粒种子都可以萌发成为原球茎，原球茎又可以产生大量的米麻和白麻，完全可以解决规模化栽培的麻种需求。

种麻需要的数量主要是根据商品天麻的栽培面积进行计划。每平方米的栽培面积需要的蒴果数量为1~2个，每个箭麻上可以保留20~30个蒴果，1个箭麻开花后获得的种子就可以满足20平米的栽培。

目前天麻有性繁殖成功的方法是将天麻的种子拌入萌发菌中，萌发出芽生长，经过1年左右的时间就可以长成白麻，1.5~2年时间可长成箭麻，并且能生成很多米麻。天麻的有性繁殖栽培可防止天麻种栽的退化，提高天麻的繁殖率和产量。通过人工授粉杂交，可培养出优质和高产的天麻品种。