甘草无论直播或根茎繁殖的甘草，在出苗前都要保持土壤湿润，特别是直播甘草，如在出苗中途发生土壤水分亏缺会造成发芽停滞，芽干而死亡，甘草严重缺苗甚至不出苗。因此，在播种前一定要灌足底墒。甘草具有较强的抗旱性，苗期一般不浇水，促进根系生长，进入到分枝盛期，需要灌水，保证植株正常生长，以后根据田间墒情和植株长势，适当灌水，浇水次数不宜过频，特别要注意"迟浇头水"。甘草是深根性植物，在出苗后，甘草主根随着土壤水层的下降，迅速向下延伸生长，形成长长的主根。如果这时浇水过勤则会导致甘草萌发大量侧根，影响药材根型。一般在苗高12厘米以上，出现8~10片真叶后浇头水，灌量1500立方/公顷，保证每次浇水浇透，这样有利于根系向下生长。雨季土壤湿度过大会使根部腐烂，所以应特别注意排除积水，充分降低土壤湿度，以利根部正常生长。11月上、中旬冬灌，灌溉定额为1500立方/公顷。全年3~4水。