灵芝菌种的保藏冷冻真空干燥法简称冷冻干燥，即将液体的样品在极低温度下快速冷冻，然后经真空干燥，使菌体细胞的结构与成分保持原来状态。该法是采用低温、干燥和真空等手段来保藏菌种，使菌种的新陈代谢活动处于最低水平，达到长期保藏的目的。冷冻干燥是目前应用很广泛，效果较好的一种菌种保藏方法。还有液氮超低温保藏法是将菌种放人装有保护剂的安瓿瓶中，密封后，经控制降温速度冻结，然后贮藏在一196~一150℃液态氮超低温冰箱中。由于超低温能使微生物的代谢能力降到最低水平，因此菌种基本上不发生变异。用这种方法还能保存那些不能用冷冻干燥保藏的菌种。目前，国际上正大力推广应用这一新技术。